日本人在經歷這場血淚劫難的同時，文化珍品。也遭到了大掠奪。據查，徵日元軍侵佔鎌倉和江戶東京以後，鎌倉的鶴岡八幡宮，還有圓覺寺、建長寺、妙本寺、明月院、東慶寺、海藏寺等古老寺院，及名景鎌倉的大佛等都不同程度的遭到元軍的掠奪和破壞。
元軍在日本的。暴行，屠殺和姦淫並未因觸目驚心、滿耳的哀鴻遍野而終止，或者是收斂。因為殘暴在蒙古人的心裡根本就沒有一絲負罪感。元軍以嚴格紀律、呆板的無條件的服從，使下級或士兵接受任何命令，不僅來自上級或直接發號施令者，更認為所有命令皆來自大元帝國的最高峰，即大元皇帝忽必烈本人。
蒙古之殘酷和輕生與其所處的地理環境、生存環境、及遊牧習性也是不可分的。忽必烈將治下所有人分為四等的目的，也就是培養其使命感及為&ldo;蒙古人&rdo;的自負感。日本的小小島國，自然會使蒙古人對日本人普遍輕視。殺一個日本人，在他們眼裡就如殺一隻貓或狗一樣。元軍像平時在草原上打獵一樣在街上射殺日本平民。視日本人的生命簡直不如一蟲蟻了。
其次，掠奪與徵收也與&ldo;東京大屠殺&rdo;有關。在戰時國家有計劃的侵略掠奪與個人犯罪的搶劫就混而為一了。
徵日元軍計十三萬人從去年就從九州開始往北進攻，由於今年八月間的颱風，阿塔海所帶的輜重全部丟失在大海之中，交通破壞，大軍分散，糧食無法補給，而大元內部又是四處作戰，無奈之下在忽必烈的詔令下實行&ldo;自行籌備&rdo;。
其實元軍在尾張、三河等地就開始&ldo;自行籌備&rdo;來維持大軍所需。徵收成為各軍的主要活動，經常進行，迅即演變成為搶劫、強姦、焚燒及屠殺。
江南軍還好一點，特別是洪茶丘所領的東路軍因為組成是由高麗人和一些蒙古人組成的，一般來說採取都是&ldo;三光作戰&rdo;，即對日本人不分軍民全部的殺光，將財物資源全部搶光，將人民居住的市街、村莊全部燒光。最後，由於給養問題，李庭所率的江南軍和阿塔海親自率領的江南新軍終於也忍受不住，由暗地進行，轉移到明目張膽起來。
最大的原因由於在對馬島登陸的時候輜重盡失，而這次攻打鎌倉、東京時大軍推進神速，也可以說是深入到敵國腹地，就算是日本人丟下武器向元軍投降。要處理這麼多俘虜，糧食方面是個最大的問題。
全部殺掉這些俘虜。在阿塔海一眾元朝將領看來，是最為明智的命令。由於這一命令，大屠殺開始了。
其實在江南軍李庭的第一線大軍接近東京城一、二里之處，彼此正在混戰時，看到滿地跪著的俘虜，李庭也曾經下令收容，但是隨即接到徵日總指揮阿塔海的命令：&ldo;不能接受日本人的投降，並予以處置。&rdo;李庭雖然隨這個命令有些實在無法接受，因為他面前跪著的可是有上萬名俘虜啊，但是身為漢軍本來地位就不如蒙古人，再則阿塔海又是自己的上司，只能聽從命令，處理了事。
徵日總指揮阿塔海，一個月之後，案前放著一份。由手下書記官送過來的一份統計，這是準備送往大都皇帝的奏報。
&ldo;計被我大軍所俘日本軍民，在鶴岡八幡宮，還有圓覺寺、建長寺、妙本寺、明月院、東慶寺、海藏寺等處，處理反抗俘虜達十九萬人以上；在江戶港碼頭、下町、山之手、鎌倉等處，被斬殺的反抗日軍十五萬人左右，共計剿滅敵軍三十萬人。&rdo;
阿塔海看著這個數字，心裡還是不由的一陣好笑，日本真的有那麼多的軍隊，幾乎是我們大元軍隊的三倍了，我們還能大勝，看來這個事情只有皇上才能相信吧，不過對於現在四面楚歌的大元，倒算的上一個好訊息，當下也不猶豫，在上面蓋上